El 13 de enero de 1994, con 13 comunidades indígenas se fundó la Central Indígena Paikoneka (CIP-SJ) y desde sus inicios ha sido la voz del indígena chiquitano de San Javier.
El nombre de Paikoneka surge de la palabra paico, que en esos momentos, se refería a la gente indígena que trabajaba en las haciendas ganaderas.
La Central Indígena Paikoneka a través de la Unidad de Proyectos Especiales ha sido beneficiada con terrenos y construcción de infraestructura, de un Centro Pre-natal, para las mujeres de las comunidades indigenas afiliadas a la Central Indígena Paikoneka, en San Javier.
La Organización Indígena Paikoneka de San Javier (CIP-SJ) y la Organización de Mujeres Indígenas Paikonekas (OMIP-SJ) junto a sus 60 comunidades afiliadas, se declaran en estado de emergencia y alerta permanente debido a la amenaza del alcalde de San Javier, que pretende utilizar dichos predios del Centro Pre-natal, para acondicionar en salas de atención de enfermos con COVID-19, aduciendo que dichos terrenos y construcción son de propiedad del Municipio de San Javier.
